コウモリ恐怖症（コウモリきょうふしょう、英語: Chiroptophobia）は、コウモリに対して、不潔や病原菌を持っているのではと言う感情により恐怖心を抱く恐怖症。コウモリを目視した場合、強い恐怖感、危機感などを感じる。