タンパク質構造多様性データベース

PCDB
内容
説明	タンパク質構造の多様性
コンタクト
研究拠点	ナシオナル・デ・キルメス大学
研究所	Centro de Estudios e Investigaciones
作者	Ezequiel I Juritz
主要引用	Juritz & al. (2011)[1]
公開日	2010
アクセス
ウェブサイト	http://www.pcdb.unq.edu.ar
ツール
その他

タンパク質構造多様性データベース（英: Database of protein conformational diversity、PCDB）は、X線結晶構造解析によって決定されたタンパク質ドメイン内のタンパク質三次構造の多様性を示すデータベースである[1][2]。タンパク質は本質的に柔軟性を持っており、本データベースは分子研究で使用するために、このテーマに関する情報を収集する。本データベースは、各タンパク質の構造の出所としてCATHデータベースを使用し、それらの重ね合わせに基づく構造の違いの範囲を記載し、最大RMSDを報告する。このデータベースのインターフェースは、研究者がさまざまなコンフォメーションの柔軟性を持つタンパク質を見つけることを可能にし、たとえば、非常に柔軟性の高いタンパク質を見つけることができる。このデータベースは、アルゼンチンのナシオナル・デ・キルメス大学の研究者グループによって運営および維持されている。

参照項目

脚注

Juritz EI, Alberti SF, Parisi GD (January 2011). “PCDB: a database of protein conformational diversity”. Nucleic Acids Res. 39 (Database issue): D475–9. doi:10.1093/nar/gkq1181. PMC 3013735. PMID 21097895.
Galperin MY, Cochrane GR (January 2011). “The 2011 Nucleic Acids Research Database Issue and the online Molecular Biology Database Collection”. Nucleic Acids Res. 39 (Database issue): D1–6. doi:10.1093/nar/gkq1243. PMC 3013748. PMID 21177655.

外部リンク

“Protein Conformational Database”. Structural Bioinformatics Group; National University of Quilmes. 2012年3月30日時点のオリジナルよりアーカイブ。2011年8月19日閲覧。

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[pmid21097895-1] Juritz EI, Alberti SF, Parisi GD (January 2011). “PCDB: a database of protein conformational diversity”. Nucleic Acids Res. 39 (Database issue): D475–9. doi:10.1093/nar/gkq1181. PMC 3013735. PMID 21097895.

[pmid21177655-2] Galperin MY, Cochrane GR (January 2011). “The 2011 Nucleic Acids Research Database Issue and the online Molecular Biology Database Collection”. Nucleic Acids Res. 39 (Database issue): D1–6. doi:10.1093/nar/gkq1243. PMC 3013748. PMID 21177655.