由岐城（ゆきじょう）は、徳島県海部郡美波町にあった日本の城。
築城年代は不明。戦国期には由岐有興がいたことが知られる。 天正3年(1575年)に海部城が土佐国の長宗我部元親に攻め落とされると、まもなく降伏した。天正10年(1582年)に中富川の戦いが行われた際、由岐有興は討死したと言われる。
