ホスホリボシルアミン—グリシンリガーゼ
ホスホリボシルアミン—グリシンリガーゼ(phosphoribosylamine—glycine ligase)またはグリシンアミドリボヌクレオチドシンテターゼ(glycinamide ribonucleotide synthetase, GARS)は、ホスホリボシルアミン(PRA)とグリシンをアミド結合させ、グリシンアミドリボヌクレオチド(GAR)に変換する酵素である。プリン塩基のde novo合成経路の第2段階を担う。
- ATP + 5-ホスホ-D-リボシルアミン + グリシン ADP + リン酸 + N1-(5-ホスホ-D-リボシル)グリシンアミド
| ホスホリボシルアミン—グリシンリガーゼ | |||||||||
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| 識別子 | |||||||||
| EC番号 | 6.3.4.13 | ||||||||
| CAS登録番号 | 9032-01-3 | ||||||||
| データベース | |||||||||
| IntEnz | IntEnz view | ||||||||
| BRENDA | BRENDA entry | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme view | ||||||||
| KEGG | KEGG entry | ||||||||
| MetaCyc | metabolic pathway | ||||||||
| PRIAM | profile | ||||||||
| PDB構造 | RCSB PDB PDBj PDBe PDBsum | ||||||||
| 遺伝子オントロジー | AmiGO / QuickGO | ||||||||
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構造
原核生物ではpurD遺伝子にコードされる単一機能の酵素である。真核生物でも緑色植物などでは単一機能の酵素であるが、真菌では3段階後の反応を触媒するFGAMシクロリガーゼと融合した2機能酵素になっている。また後生動物ではすぐ後段のGARホルミルトランスフェラーゼおよびFGAMシクロリガーゼと融合した3機能酵素である[1]。
反応機構
反応はグリシンの酸素原子がATPの末端のリン原子を求核攻撃して中間体となり、そのカルボニル基に対してPRAの窒素原子が攻撃することでGARが生成する。基質はPRA、ATP、グリシンの順に酵素に結合し、生成物はリン酸、ADP、GARの順に解離する[2]。
参考文献
- Daubner et al. (1985). “A Multifunctional Protein Possessing Glycinamide Ribonucleotide Synthetase, Glycinamide Ribonucleotide Transformylase, and Aminoimidazole Ribonucleotide Synthetase Activities in de Novo Purine Biosynthesis”. Biochemistry 24 (25): 7059, 7061–7062. doi:10.1021/bi00346a006. PMID 4084560.
- Sampei et al. (2010). “Crystal structures of glycinamide ribonucleotide synthetase, PurD, from thermophilic eubacteria”. J. Biochemistry 148 (4): 429–437. doi:10.1093/jb/mvq088. PMID 20716513.
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