第48回全日本大学サッカー選手権大会

9地域の代表15校と総理大臣杯全日本大学サッカートーナメント優勝校が参加した。

• 国士舘大学（総理大臣杯優勝・5年連続15回目）
• 道都大学（北海道代表・初）
• 岩手大学（東北代表・4年ぶり4回目）
• 筑波大学（関東第1代表・2年ぶり24回目）
• 駒澤大学（関東第2代表・2年ぶり5回目）
• 東京学芸大学（関東第3代表・初[1]）
• 順天堂大学（関東第5代表・4年連続13回目）
• 福井工業大学（北信越代表・3年連続6回目）
• 静岡産業大学（東海代表・2年連続2回目）
• 近畿大学（関西第1代表・初[2]）
• 阪南大学（関西第2代表・2年連続5回目）
• 関西学院大学（関西第3代表・2年連続9回目）
• 広島修道大学（中国代表・8年ぶり6回目）
• 高知大学（四国代表・6年連続15回目）
• 福岡教育大学（九州第1代表・3年連続3回目）
• 九州産業大学（九州第2代表・13年ぶり18回目）

• 千代反田充（筑波大学）
• 谷池洋平（筑波大学）
• 吉川京輔（筑波大学）
• 羽生直剛（筑波大学）
• 渡辺隆正（筑波大学）
• 平川忠亮（筑波大学）
• 戸田光洋（筑波大学）
• 小野隆儀（筑波大学）
• 曽田雄志（筑波大学）
• 巻誠一郎（駒澤大学）
• 深井正樹（駒澤大学）
• 堀之内聖（東京学芸大学）
• 本多進司（東京学芸大学）
• 藤倉寛（東京学芸大学）
• 西村卓朗（国士舘大学）
• 山根伸泉（国士舘大学）
• 早川知伸（順天堂大学）
• 石原克哉（順天堂大学）
• 佐伯直哉（国士舘大学）
• 影山貴志（阪南大学）
• 町中大輔（近畿大学）

1. 自由参加制時代に11回出場
2. 自由参加制時代に2回出場・棄権1回

• “福井工大8強入り”. 朝日新聞. (1999年11月14日)
• “関学、26年ぶり4強”. 朝日新聞. (1999年11月15日)
• “国士と筑波、決勝に進出”. 朝日新聞. (1999年11月22日)
• “国士大、逆転で連覇”. 朝日新聞. (1999年11月24日)