元和元年(1615年)、稲垣重綱が大坂の陣で戦功を挙げたことにより、翌年に上野国伊勢崎藩1万石から藤井2万石に加増移封されたことにより立藩した。しかし元和6年(1620年)に3000石加増の上で越後三条藩へ移封され、藤井藩は廃藩となった。
譜代。2万石。
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藩庁の置かれた地域を基準に分類しているが、他の地方に移転している藩もある。順番は『三百藩戊辰戦争事典』による。 明治期の変更: ★=新設、●=廃止、○=移転・改称、▲=任知藩事前に本藩に併合。()内は移転・改称・併合後の藩名。()のないものは県に編入。 | ||