D-アラニル-D-アラニンリガーゼ

D-アラニル-D-アラニンリガーゼ(D-alanine-D-alanine ligase、EC 6.3.2.4)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。

ATP + 2 D-アラニンADP + リン酸 + D-アラニル-D-アラニン
D-アラニル-D-アラニンリガーゼ
識別子
EC番号 6.3.2.4
CAS登録番号 9023-63-6
データベース
IntEnz IntEnz view
BRENDA BRENDA entry
ExPASy NiceZyme view
KEGG KEGG entry
MetaCyc metabolic pathway
PRIAM profile
PDB構造 RCSB PDB PDBj PDBe PDBsum
遺伝子オントロジー AmiGO / QuickGO
検索
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従って、この酵素の基質はATPとD-アラニンの2つ、生成物はADPとリン酸とD-アラニル-D-アラニンの3つである。

この酵素はリガーゼ、特に酸-D-アミノ酸リガーゼ（ペプチドシンターゼ）に分類される。系統名は、D-アラニン:D-アラニン リガーゼ (ADP形成)(D-alanine:D-alanine ligase (ADP-forming))である。他に、alanine:alanine ligase (ADP-forming)、alanylalanine synthetase等とも呼ばれる。この酵素は、D-アラニンの代謝及びペプチドグリカンの生合成に関与している。ホスフィン酸とD-シクロセリンは、この酵素の酵素阻害剤として知られている。

D-アラニル-D-アラニンリガーゼのN末端は基質結合領域、C末端は触媒ドメイン領域と考えられている[1]。

構造

2007年末時点で、8個の構造が解明されている。蛋白質構造データバンクのコードは、1EHI、1IOV、1IOW、2DLN、2FB9、2I80、2I87及び2I8Cである。

出典
  1. Roper DI, Huyton T, Vagin A, Dodson G (August 2000). “The molecular basis of vancomycin resistance in clinically relevant Enterococci: crystal structure of D-alanyl-D-lactate ligase (VanA)”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97 (16): 8921-5. doi:10.1073/pnas.150116497. PMC 16797. PMID 10908650. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC16797/.

関連文献
  • Ito, E and Strominger JL (1962). “Enzymatic synthesis of the peptide in bacterial uridine nucleotides II. Enzymatic synthesis and addition of D-alanyl-D-alanine”. J. Biol. Chem. 237: 2696–2703.
  • Neuhaus FC (1962). “Kinetic studies on D-Ala-D-Ala synthetase”. Fed. Proc. 21: 229.
  • van Heijenoort J (2001). “Recent advances in the formation of the bacterial peptidoglycan monomer unit”. Nat. Prod. Rep. 18 (5): 503–19. doi:10.1039/a804532a. PMID 11699883.
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