神雄寺跡

谷筋の中央を幅4から5mの川の跡(SR01)が北から南に流れ更に大きく西側に曲がっていた[15]。この川の下流部には堤(SX2053)が設けられ水位が調整されていた。川の北側の天神山の山すそに「仏堂」とされる礎石建物跡(SB301)がある。仏堂は内部に須弥壇を有している。仏堂の建物の復元案は2種あって、A案は幅4.8m奥行4.5m、B案では幅7.2m奥行4.5mであり、ともにかなり小さい。仏堂の出土品から複数の天部の像（四天王の可能性が示唆されている）が安置されていたことが判明している。仏堂と川の間に「礼堂跡」とされる幅8.1m奥行4.2mの掘立柱建物跡(SB01)があり、川の東に掘立柱建物跡(SB02)と井戸の跡(SE01)が見つかっている。これらの遺構からは瓦が出土しているがその量は多くないため、屋根の一部に使われたものと推定されている。なお川の水源は背後の天神山の湧水が使われた。

川跡(SR01)から「短期間燈明の用に供された後、直ちに廃棄された」大量の灯明皿が出土した[16]。 出土状況から川岸から川に向けて多数の皿を廃棄したと考えられ、上流部で150枚、中下流部の5か所で1000枚の灯明皿が一度に廃棄されており、燃灯供養を行ったと考えられている[17]。

北から南へ流れていた川の部分を東側に掘り直し流路を狭めた(SD2002)。川の東にあった掘立柱建物(SB02)は取り壊されその跡地に別の掘立柱建物(SB03)が建てられた。また天神山の中腹に1.8m四方の大きさの塔(SB501)が建立された。

• 掘り直された流路跡(SD2002)から灯明皿が出土しているが、量は第1期ほど多くない。
• 歌木簡、「阿支波支乃之多波毛美智(あきはきのしたはもみち)」の文字が読める木簡が見つかったが、これは『万葉集』にある歌「秋萩の下葉もみちぬあらたまの月の経ゆけば風をいたみかも(作者不詳)」の上の部と判定された[18]。
• 墨書土器、「神雄寺」(約10点出土[19])、「神寺」、「大殿」などの文字が書かれた土器が見つかり、この遺跡が当時神雄寺であったことが判明した。
• 彩釉山水陶器、山や川をかたどった20個以上の着色した焼き物を組み合わせて、箱庭のような山水風景を表現したもの[20]。
• 釉薬で彩色された香炉や瓶や皿などの仏具類。

その後8世紀末から9世紀初頭にかけて「仏堂」は火災で焼失し、川も大半が埋没した。残った塔も10世紀前半には焼失した[21]。

『万葉集』巻八に、738年10月「右大臣橘卿之旧宅」で大伴家持らが宴飲を行い秋の「黄葉」を読み込んだ歌を作ったとあるが、神雄寺跡からは「黄葉」と墨書された土器が複数発見されており、同地が橘諸兄の邸宅の一つであった可能性が指摘されている[28]。また上記の歌木簡「阿支波支乃之多波毛美智」の裏面に「越中守」と墨書されており、『万葉集』の編纂を行った大伴家持が一時越中守であったことから、寺と『万葉集』編纂の関連性が指摘されている[29]。

財団法人京都府埋蔵文化財調査研究センターが2007年度に実施した。火をともした多数の灯明皿を水流に浮かべて供養する宗教行事である「燃灯供養」を行った水流址と灯明皿、「神雄寺」等が墨書された土器、『万葉集』に記載のある歌が記載された木簡などが見つかった[30]。

神雄寺遺跡の谷の下流にある分廻池を西からみる、背後の丘が天神山で、右斜面と民家の間の谷が神雄寺遺跡

木津川市教育委員会が2008年度から2011年度にかけて発掘範囲を広げて実施した。水流の周囲に複数の建物、北の丘（天神山）の中腹に塔の跡などが見つかった[31]。これらの調査の結果から「木津中央特定土地区画整理事業」が見直され計画の一部が変更された[32]。2012年には木津川市から文化庁に対し史跡指定の具申を行い、2015年3月10日に国から「神雄寺跡」として史跡指定を受けた[1][33]。