首都圏ICカード相互利用サービス

Suica・PASMOいずれのエリアでも、改札機にSuica・PASMOをタッチすることで、入金（チャージ）残額から自動的に運賃を差し引く。連絡割引等についても自動的に適用される（ただし、重複する場合は最も割引額の大きい方のみの適用となる。また、改札を通る必要のない駅で改札を出場した場合、改札出場後30分以上経過した場合には適用されない）。なお、一度に精算できるのは4事業者分までである。途中一度も改札口を通らない場合は圏内で最大6事業者までの連続乗車が可能だが、運賃計算上5事業者以上になる場合は窓口での精算となる。

SuicaとPASMOはICカードの1枚使用が前提であり、磁気券で可能だった自動改札機への2枚投入や他の乗車券類との併用が自動改札機ではできない。一部事業者間の連絡改札口や新幹線の連絡改札口では磁気券+ICカードの同時使用が可能で、この場合入場時の乗車券に関係なく磁気券を挿入してからICカードをタッチする。なお、自動精算機では定期券情報・入場記録のないものに限り不足賃の支払いに使用可能である（JRでは、入場時のICカードと別のICカードの併用が可能）。

定期券で券面の区間外を利用する場合も出場時に自動精算される。なお、券面区間を経由して区間外の駅同士の相互発着となる場合は、区間外運賃の合計と区間内も含めて通しで計算した場合の運賃を比較して低廉である方の運賃を差し引く。

連絡定期券の発売範囲は、サービス開始時に従来の磁気定期券の発売範囲に加えて多摩都市モノレール・ゆりかもめ・横浜新都市交通（現・横浜シーサイドライン）の3社に拡大された。なお、IC乗車券の2枚同時使用はできないため、途中改札を通らない経路で2枚以上になる場合は従来通り磁気定期券を使用することになる。なお、町田駅など連絡運輸が締結されていない駅や連絡運輸を行っている場合でも連絡改札口が設置されていない駅（または設置されていても利用者が使用しない場合）などでは2枚のIC定期券を所持することも可能ではある。2008年3月以降、発売範囲は大幅に拡大され、前述の町田駅連絡を含め、多くが発行可能となっている。

なお、Suica・PASMOのチャージ残額を使っての振替輸送には対応しておらず（定期券券面区間を利用した場合にのみ対応）、実際に乗車した交通機関の運賃が引き落とされる[5]。

普通運賃は、実際の乗車経路に関わらず最も安くなる経路を自動計算する（ただし、下記のような例およびすでに購入時に経路が指定されている定期運賃を除く）。

改札外乗り換えを要する場合

東京地下鉄・東京都交通局（都営地下鉄）の一部の連絡駅や京成電鉄の京成高砂駅（金町線と京成本線・成田スカイアクセス線）では、同一事業者内の乗り換えにおいて一旦改札口を通って行う。この場合、60分以内に再入場しないと運賃が打ち切られ、次回入場時に乗り換え駅からの運賃が差し引かれる。また、目的地となる降車駅よりも運賃が高額となる改札外乗り換え駅を経由して乗り継ぐ場合には乗り継ぎ駅で当該駅までの運賃が差し引かれ、それより安い目的地の駅で下車した場合でも超過分は戻らない。この改札外乗り換えの駅が改札を通らずに到達した2事業者目以降となる場合には、1事業者目からこの一旦出場駅までの経路が確定することになる。同一事業者内での改札外乗換は、磁気の普通乗車券・回数券では対応する改札口・改札機が限定されている場合もある（対応していない改札機に投入すると回収される）が、ICカードの場合はその制限がなく、乗換口として指定されていない改札口同士で乗り継いでも運賃が継続される。

なお、JR鶴見線・南武線（支線）の連絡駅で、乗り換えに際して一度改札を出る必要がある浜川崎駅では、このルールは対応していないため、設置されている簡易ICカード改札機（読み取り機）にカードを読ませてはいけない。

通過連絡運輸の非適用

JRにおいて通過連絡運輸が設定されている区間であっても、IC乗車券で乗車した場合はJR線区間の前後のキロ程は通算されず、それぞれの区間の運賃が別個に適用される（途中改札口を1度も通らない場合は下記と同様に全区間JR線扱いとなる）ため、磁気乗車券と比べて高額となる場合がある。ただし、東京メトロ千代田線の北千住駅 - 西日暮里駅間を経由してJR常磐線と山手線などをIC乗車券で乗り継ぐ場合に限り3区間個別の合計した運賃から100円減額されるというルールを新たに設定している（JR[1]+千代田線[160円]+JR[2]-100円。JRの1と2のキロ程は通算されない）ため、ICカードで乗車した方が安くなるケースがある。適用区間は常磐線 亀有駅 - 取手駅間と、山手線・埼京線（赤羽線区間）・京浜東北線（蕨駅 - 品川駅間）・宇都宮線（赤羽駅以南）で囲まれた区域の各駅[注釈 1]の相互発着で、これらの各駅のきっぷうりばに掲げている運賃表にはICカードで乗車した方が安くなる駅が記載されている。

なお、この他にICカード利用エリアで通過連絡運輸を行っている区間は、東京メトロ東西線中野～西船橋間経由のみである。

他の事業者を経由して元の会社線に乗り継ぐ場合

最初に入場した事業者の駅から途中一度も改札口を通ることなく、他の事業者を経由して元の事業者の路線の駅まで乗り継ぐ場合は、入場した事業者の路線のみで乗車できる経路がある時に限り、他線経由時の運賃の方が安い場合でも全区間最初に入場した事業者の路線のみ乗車したものとする。[6]ただし、他社と改札内を共有する共同使用駅（中野駅・西船橋駅・北千住駅・綾瀬駅・八丁畷駅・小川町駅 (埼玉県)・寄居駅・下館駅）で入・出場した場合は安い方の運賃を適用する。なお、西船橋駅ではJRとJR総武線(地下鉄東西線直通)・東京地下鉄・東葉高速線の改札が分離されるとともに乗り継ぎ用の自動改札機が設置されている（運賃の計算基準は変更なし）。現在、この規定で高額な運賃が発生する可能性があるのはJRのみである。

JR南武線八丁畷駅のホームに設置してある乗継用簡易IC改札機

連絡（中間）改札がない駅で別の会社線に乗り換える場合

他社と改札内を共有する駅のうち、八丁畷駅・小川町駅 (埼玉県)の各駅には乗り継ぎ用の簡易ICカード改札機が設置されており、これにタッチすることで当該駅を通過したという情報を書き込む。これにタッチしないと中野または北千住などを経由した運賃が意図せず引き落とされる場合がある。

なお、かつては、拝島駅・伊勢崎駅・越生駅・寄居駅でも同様の取り扱いが行われていた。拝島駅については駅舎が橋上化された2007年8月24日から2008年3月14日まで自由通路の一部をJR線と西武線の連絡通路として使用していた。伊勢崎駅についても、高架化に伴うJR・東武鉄道の改札分離が行われた2010年3月13日まで、越生駅では自由通路新設に伴いJR・東武の改札が分離された2019年3月15日まで同様の取扱が行われていた。

厚木駅は、2014年2月15日から乗り継ぎ用の簡易ICカード改札機に代わり、乗り継ぎ用の基本型自動改札機が設置された。これにより、タッチを失念して改札を通過する事は無いものの、従来通り最初の改札を小田急とJRで共用しているため、ICカード利用の取扱に変化はない。

寄居駅は、2022年3月12日から秩父鉄道にPASMOが導入されたことに伴い、改札口にあったJR・東武の共通簡易ICカード改札機は八高線連絡通路上に移設の上で八高線専用となり、新たに秩父鉄道線のホーム上に秩父鉄道線専用の簡易ICカード改札機が設置された。東武東上線連絡通路上にある簡易ICカード改札機は東上線専用で変化はない。寄居駅から乗車する場合はどの鉄道会社であっても乗車路線の1回タッチだけで乗車可能になった（乗り換えの場合は乗換元路線の出場と乗換先路線の入場で必ず2回タッチが必要）。

チャージ残高が一定額未満となった場合に登録したクレジットカードを経由して自動的に一定金額をチャージするサービスで、Suica・PASMO双方で展開されているが、双方の駅の青い読み取り機が付いた自動改札機で、対応したカードであれば、Suica事業者・PASMO加盟事業者の別なくオートチャージが可能である。

このサービスは Suica 及び PASMO のエリア内でのみ有効であり、Suica / PASMO エリア外での全国相互利用サービス利用時は対象外となる。また、タッチでGo!新幹線利用時は Suica / PASMO を問わずオートチャージに対応しない。

「PASMO」「Suica」が併記された「バス特」ステッカー

利用可能なバスには、出入口に「バス特 PASMO Suica」または「PASMO Suica ご利用いただけます」というステッカーを貼付している[7]。初期のSuicaカード（電子マネー非対応のもの）は利用できないため、読み取り機に注意書きステッカーを貼付している。なお、バス車内でのチャージはSuica・PASMOの別なく可能である。

「バス特 PASMO Suica」のステッカーが掲出されたバスではSuica・PASMOいずれの利用でも『バス利用特典サービス』に対応する。PASMO・Suicaのチャージ額を利用してバスに乗ると自動的にバスポイントがたまり、一定ポイント以上貯まると自動的に「特典バスチケット」が付与され、次回バス利用時にバス運賃としてPASMO・Suicaのチャージ額に優先して10円単位で自動的に使用される。Suica / PASMO 以外の交通系ICカードは『バス利用特典サービス』に対応しない。

1回ICカードをリーダ／ライタに触れて運賃精算が完結すると、誤タッチで二重に運賃が引き落とされないように、そのバスが終点に到着するまで運賃が差し引かれないようになっているところもあるため（「処理済カードです」の表示が出る）、複数人で使用する場合は、あらかじめ申告しなければならない。

当初からSuicaショッピングサービス（現・Suica電子マネー）とPASMO電子マネーとは共通運用がなされており、Suica・PASMOの各対応店舗の別なく相互に利用可能となる。店頭でのチャージについては、Suica加盟店でのPASMOへのチャージとPASMO加盟店でのSuicaへのチャージができない例が多かったが、解消されつつある。

なおSuica・PASMOの加盟店では、JR北海道のKitaca・JR東海のTOICA・名古屋鉄道と名古屋市交通局等のmanaca・JR西日本のICOCA・JR九州のSUGOCAと、西日本鉄道等のnimoca・福岡市交通局のはやかけんの電子マネーサービスも相互利用可能である。