ルート・ファン・ニステルローイ

1993年にオランダのクラブチーム・FCデン・ボスでキャリアをスタート。セントラルミッドフィールダーからセンターフォワードへとコンバートされるとフォワードとして頭角を現し、1996-97シーズンに31試合に出場して12得点を挙げた。その翌シーズンに36万ユーロでSCヘーレンフェーンへと移籍。ヘーレンフェーン加入後、ストライカー起用をしようとしたフォッペ・デ・ハーンに対して「あなたは間違ってるよ。僕は純粋なMF」と抵抗し、前線でチャンスを待ち続けなければならないポジションでのプレーに難色を示していた[1]。しかしデ・ハーンの熱心な指導によってストライカーとして成長し、31試合で13得点を挙げた。同クラブでのプレーはその1年のみであった。1998年にPSVアイントホーフェンへ当時のオランダリーグ最高額の移籍金630万ユーロで移籍。

移籍1年目に31得点を記録してエールディヴィジ得点王となり、ヨーロッパ全体でも2番目に多い得点を決めた選手となった。その活躍からオランダリーグ最優秀選手に選ばれた。1999-2000シーズンも勢いは止まらず、2年連続でリーグ得点王、リーグ最優秀選手となった。PSVでの活躍が海外からも注目され、2000年にマンチェスター・ユナイテッドFCが獲得に名乗りを挙げ、アレックス・ファーガソン監督は、ヘーレンフェーンのトライアウトを受ける息子に「すぐにファン・ニステルローイのサインをもらってきてくれ」と頼んだとされる。また、マンチェスター・ユナイテッドはPSVに代理人を送り、契約を結んだ[2]。十字靭帯断裂のため移籍は先送りとなり、翌2001年に入団。

移籍1年目にアラン・シアラーやティエリ・アンリらと並んでリーグ記録となる8試合連続ゴールを決めるなど23得点を挙げ、プレミアリーグの得点ランクで2位タイにつけた。また、UEFAチャンピオンズリーグでも10得点を記録し、大会得点王となる。その年、PFA年間最優秀選手賞にも選ばれた。

マンチェスター・ユナイテッド時代

翌年もUEFAチャンピオンズリーグ得点王、更に3つのハットトリックを含む25得点でプレミアリーグ得点王に輝くなど、オランダのみならず世界有数のストライカーに成長した。2004年2月7日、エヴァートンFC戦ではクラブ通算100得点を達成し、ミルウォールとのFAカップ決勝ではPKを含む2ゴールを挙げ、タイトル獲得に貢献した[3]。2004-05シーズンは怪我によりリーグの多くを欠場した。しかし、UEFAチャンピオンズリーグでは8得点を記録し、3度目の得点王となる。2004年9月16日のオリンピック・リヨン戦での得点はマンチェスター・ユナイテッドでのチャンピオンズリーグ29得点目となり、デニス・ローの有していた欧州大会におけるクラブ最多得点記録28を更新した。

2005-06シーズンもゴールを量産し、最終的に得点ランク2位となる21得点を決めたものの、ウィガン・アスレティックFCとのフットボールリーグカップ決勝などを始めベンチで過ごすことが増えた。ウェイン・ルーニーを主軸にルイ・サハとファン・ニステルローイをチョイスする監督のアレックス・ファーガソンの起用法に反発。また、クロッサーとしてホットラインを築いていたデビッド・ベッカムの移籍後に同ポジションに収まったクリスティアーノ・ロナウドとそりが合わなかったことなどもあり、2006年7月27日に移籍金1500万ユーロでレアル・マドリードに移籍した[4]。

移籍早々のリーグ第2節レバンテUD戦でハットトリックの活躍をみせると、2006年11月12日のCAオサスナ戦では前半のみでハットトリックを達成し、後半にも1点を追加し計4得点を取るなど、1年目から得点を量産。優勝がかかった終盤戦でも、31節から37節までウーゴ・サンチェス以来となる7試合連続ゴールを決めた[5]。これによりチームのリーグ優勝に貢献し、個人としても25得点をあげ得点王となった。しかし、2007-08シーズンの後半に負傷した際、メディカルスタッフやプレドラグ・ミヤトヴィッチSDの制止にも関わらず、独断でアメリカで手術を行い残りのシーズンをふいにした。2008-09シーズンにも負傷をしてしまい、診断のためアメリカへと渡った（この時はクラブとの合意を得た上で行った）。その結果、右膝半月板の損傷とされ、シーズン中での復帰は絶望とされた[6]。

2009年9月20日のシェレスCD戦で80分にクリスティアーノ・ロナウドに代わって復帰を果たし、89分にはゴールも挙げたが、その試合で再び怪我に見舞われてしまい、6週間の離脱を余儀なくされた[7]。本人はレアル・マドリードで現役生活を終えたいと代理人を通じ語ったが、レアル・マドリードが2009年夏の移籍市場に行った大型補強の結果、出場機会が激減し、2010年1月24日にレアル・マドリードとの契約を解除してハンブルガーSVに1年半の契約で移籍した[8]。

2010年2月6日の1.FCケルン戦で途中出場しブンデスリーガデビューを飾ると、続く同月13日のシュトゥットガルト戦で2得点を挙げた。3月11日のUEFAヨーロッパリーグラウンド16のアンデルレヒト戦1stレグでは、ヨーロッパリーグ初得点を挙げた。

2011年冬の移籍市場で、ゴンサロ・イグアインの離脱によってFWの補強が急務になったレアル・マドリードへのレンタルでの復帰が取り沙汰された[9]。ファン・ニステルローイ自身もこの移籍には乗り気であり、移籍金の一部を自ら負担する姿勢もみせた。しかし、ハンブルガーSV側はこのオファーを拒否した。その影響もあってか、シーズン後半戦はわずか2得点に終わった。2011年6月2日、大型補強を行っていたマラガCFへの移籍を発表。フリーでの1年契約であり、約1年半ぶりのスペイン復帰となった[10]。

2011年10月1日のヘタフェCF戦で移籍後初得点を記録した。2012年5月14日に現役引退を表明した。

オランダ代表で練習中のファン・ニステルローイ

オランダ代表には1998年11月19日のドイツ戦で代表デビューを果たす。2006ドイツワールドカップメンバーにも選ばれたが、監督のファン・バステンの起用法などに不満を持ち、大会終了後には「マルコ（ファン・バステン）がベンチにいる間は代表として戦わない」とその後の代表招集を拒み続ける。また、EURO2008予選で若手FWの1人だったフンテラールが怪我で出場できない試合があった時にファン・バステンから直接出てくれないかと電話があったが、ファン・ニステルローイは断った。フンテラールの代役という形が嫌だったらしい。その後、ファン・バステンと和解し、2007年8月22日のスイスとの親善試合からオランダ代表に復帰している。

2008年8月5日、代表引退を発表した。しかし、「2010南アフリカワールドカップに出て欲しいと言うのなら、NOとは言えない」と代表復帰を匂わす発言をしている。また、半月板の負傷により離脱している間には「代表チームから招集されて、W杯でプレーできるように戦いたい」と語った[11]。

2010南アフリカワールドカップは代表選考から漏れ、出場できなかった。

2010年8月30日にロビン・ファン・ペルシの負傷により、代役として2年ぶりに代表に招集された。9月3日のEURO2012予選のサンマリノ戦で途中出場し2年ぶりの得点も挙げた。

2014年3月28日、2014 FIFAワールドカップ後にオランダ代表監督に就任するフース・ヒディンクのアシスタントコーチに就任することが決定した[12]。2015年6月29日にヒディンクが退任し、後任にダニー・ブリントが監督に就任しても、引き続きコーチ職に留任している。

2016年2月3日、2016-17シーズンから古巣PSVの下部組織のU-19カテゴリーのコーチに就任することが発表された[13]。同時にオランダ代表のアシスタントコーチ職からは辞職した。

2019年12月17日、オランダサッカー協会はファン・ニステルローイのオランダ代表のアシスタントコーチ再任を発表した[14]。PSVの下部組織の監督との兼任となる

2021年、2021-2022シーズンよりヨングPSV（U-21）監督に就任。

2022年3月30日、PSVは、2021-2022シーズン終了後に退任するロガー・シュミット監督の後任として、ファン・ニステルローイがトップチームの監督に昇格することを発表した。

PSVアイントホーフェン

• エールディヴィジ : 1999-00, 2000-01

マンチェスター・ユナイテッド

• FAプレミアリーグ : 2002-03

レアル・マドリード

• プリメーラ・ディビシオン : 2006-07, 2007-08

• エールディヴィジ得点王 : 2回（1998-99, 1999-00）
• FAプレミアリーグ得点王 : 1回（2002-03）
• プリメーラ・ディビシオン得点王 : 1回（2006-07）
• チャンピオンズリーグ得点王 : 3回（2001-2002, 2002-2003, 2004-2005）
• FIFA 100