第6回日本フットボールリーグ

• 年間2回総当り、1チーム30試合（全240試合）を行い、勝ち点により順位を決定する。全30節を15節ごとに前期・後期に分け、前期の順位によって天皇杯の出場権が与えられる。
• 試合は前後半90分で行い、決着がつかなければ引き分けとなる。勝利には勝ち点3、引き分けには勝ち点1、敗北には勝ち点0が与えられる。
• Jリーグ参入の成績面の条件は年間順位2位以上。その上でJリーグ臨時理事会の承認を得られれば次年度からJ2に参入することができる。
• 自動降格となるチームはなし。年間順位15位・16位のチームは全国地域リーグ決勝大会の1位・2位のチームと入れ替え戦を行う。

前期終了時の上位3チームに第84回天皇杯の出場権が与えられる。

• 各試合において勝利チームに勝利チーム賞10万円を支払う。引き分けの場合でも良いゲームをしたチームには「グッドチーム賞」として5万円を支払う（両チーム対象の場合は2.5万円）。
• 各試合において1得点につき1万円を支払う（試合結果に関係なし）。

J2加盟を申請していた大塚製薬、ザスパ草津、愛媛FCに対して12月6日のJリーグ臨時理事会で審議が行われ、1位の大塚製薬と3位のザスパ草津のJリーグ加盟が正式に承認された（本来2位以内が加盟の要件であったが、3位のザスパ草津は2位のHonda FCと勝ち点・得失点差が同じで得点差1だったことが考慮された）。5位の愛媛FCの加盟は見送られた。なお、大塚製薬はJリーグ加盟後に徳島ヴォルティスへクラブ名称を変更した。

国士舘大学がチーム内の不祥事のため、JFLから脱退する事となった。

Jリーグ加盟及びJFL脱退により3チーム減少したため、JFLと地域リーグ間の昇降格のレギュレーションが以下のように変更された。

レギュレーション変更により、全国地域リーグ決勝大会1位の三菱自動車水島、2位の流通経済大学、3位のホンダロックSCがJFLへの自動昇格となった。

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2004年8月13日 17:50 (現地時間) 予選ラウンド第1戦

JFL選抜	2 - 1	DCスファクシャン ( チュニジア)
増田勝文  34分 濱岡和久  67分	公式記録 (PDF)	D.Rassem  6分

サウルタン・アブドゥラ・アルアジャス、サウジアラビア・アブハー 観客数: 500人

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2004年8月16日 20:40 (現地時間) 予選ラウンド第2戦

JFL選抜	0 - 1	アル・ヒラル ( サウジアラビア)
	公式記録 (PDF)	M.Al-Farraj  89分

サウルタン・アブドゥラ・アルアジャス、サウジアラビア・アブハー 観客数: 1,500人

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2004年8月18日 17:40 (現地時間) 予選ラウンド第3戦

JFL選抜	0 - 1	ジョモ・コスモス ( 南アフリカ共和国)
	公式記録 (PDF)	C.Heltonsomo  19分

サウルタン・アブドゥラ・アルアジャス、サウジアラビア・アブハー 観客数: 500人

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2004年8月20日 20:40 (現地時間) 予選ラウンド第4戦

JFL選抜	0 - 0	アル・イテハド ( サウジアラビア)
	公式記録 (PDF)

サウルタン・アブドゥラ・アルアジャス、サウジアラビア・アブハー 観客数: 1,500人

この結果、1勝1分2敗で予選ラウンド敗退が決まった。